ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ

മനുഷ്യന്റെ കുടൽ സിംബയന്റിലുള്ള ആൽഫ-മനോസിഡേസുകളുടെ Ca2+-ആശ്രിത കുടുംബത്തിലേക്കുള്ള യാന്ത്രിക സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ.

Bacteroides thetaiotaomicron ഉദാഹരിക്കുന്ന കോളനി ബാക്ടീരിയ, ഭക്ഷണത്തിലെ പോളിസാക്രറൈഡുകളും ആതിഥേയ ഗ്ലൈക്കാനുകളും പോഷകങ്ങളായി ഉപയോഗപ്പെടുത്തുന്നതിനായി ഗ്ലൈക്കോസൈഡ് ഹൈഡ്രോലേസുകളുടെ (GHs) വലിയ കുടുംബങ്ങളെ ഉപയോഗപ്പെടുത്തി മനുഷ്യന്റെ ആരോഗ്യം നിലനിർത്തുന്നതിൽ പ്രധാന പങ്ക് വഹിക്കുന്നു.B. thetaiotaomicron ജീനോം എൻകോഡ് ചെയ്ത 23 ഫാമിലി GH92 ഗ്ലൈക്കോസിഡേസുകളാണ് ഇത്തരം GH കുടുംബ വികാസത്തിന് ഉദാഹരണം.ഹോസ്റ്റ് എൻ-ഗ്ലൈക്കാനുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് ഒരൊറ്റ ഡിസ്പ്ലേസ്മെന്റ് മെക്കാനിസം വഴി പ്രവർത്തിക്കുന്ന ആൽഫ-മനോസിഡേസുകളാണിവയെന്ന് ഞങ്ങൾ ഇവിടെ കാണിക്കുന്നു.രണ്ട് GH92 മന്നോസിഡേസുകളുടെ ത്രിമാന ഘടന രണ്ട്-ഡൊമെയ്ൻ പ്രോട്ടീനുകളുടെ ഒരു കുടുംബത്തെ നിർവചിക്കുന്നു, അതിൽ കാറ്റലിറ്റിക് സെന്റർ ഡൊമെയ്ൻ ഇന്റർഫേസിൽ സ്ഥിതിചെയ്യുന്നു, ഇത് Ca(2+)-ൽ ജലവിശ്ലേഷണത്തിന് ആസിഡും (ഗ്ലൂട്ടാമേറ്റ്) ബേസ് (അസ്പാർട്ടേറ്റ്) സഹായവും നൽകുന്നു. ആശ്രിത രീതി.ഇൻഹിബിറ്ററുകളുള്ള സങ്കീർണ്ണമായ GH92-കളുടെ ത്രിമാന ഘടനകൾ കാറ്റലിസിസിന്റെ പ്രത്യേകത, സംവിധാനം, അനുരൂപമായ യാത്രാക്രമം എന്നിവയിൽ ഉൾക്കാഴ്ച നൽകുന്നു.മാനോസൈഡിനെ അതിന്റെ ഭൗമോപരിതലത്തിൽ (4)C(1) ചെയർ കോൺഫോർമേഷനിൽ നിന്ന് പരിവർത്തന നിലയിലേക്ക് വികലമാക്കാൻ സഹായിക്കുന്നതിൽ Ca(2+) ഒരു പ്രധാന ഉത്തേജക പങ്ക് വഹിക്കുന്നു. (ബിബ്ലിയോഗ്രഫി: Nat.ചെം.ബയോൾ.6, 125-32, (2010)

ഒരു കോൺകനാവലിൻ എ-സെഫറോസ് കോളത്തിൽ ഓവൽബുമിൻ ഗ്ലൈക്കോസ്പരാഗൈനുകളുടെ ഫ്രണ്ടൽ അഫിനിറ്റി ക്രോമാറ്റോഗ്രഫി.ലെക്റ്റിന്റെ ബൈൻഡിംഗ് പ്രത്യേകതയെക്കുറിച്ചുള്ള ഒരു അളവ് പഠനം.

ഓവൽബുമിനിൽ നിന്ന് ഉരുത്തിരിഞ്ഞ 10 ഗ്ലൈക്കോസ്പരാഗൈനുകളുമായുള്ള സെഫറോസ് 4 ബി-ഇമ്മൊബിലൈസ്ഡ് കോൺകനാവലിൻ എ (ConA) യുടെ പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങൾ ഫ്രണ്ടൽ അഫിനിറ്റി ക്രോമാറ്റോഗ്രാഫിയുടെ അളവനുസരിച്ച് പരിശോധിച്ചു.ഈ രീതിയിൽ, ConA-Sepharose നിരയിൽ ഒരു കാർബോഹൈഡ്രേറ്റ് ലായനി തുടർച്ചയായി പ്രയോഗിക്കുന്നു, കൂടാതെ എല്യൂഷൻ ഫ്രണ്ടിന്റെ റിട്ടാർഡേഷൻ പ്രതിപ്രവർത്തനത്തിന്റെ ശക്തിയുടെ ഒരു പാരാമീറ്ററായി അളക്കുന്നു.ConA ഉള്ള ഓരോ സാക്കറൈഡിനും ഡിസോസിയേഷൻ കോൺസ്റ്റന്റ് (Kd) നിർണ്ണയിക്കാവുന്നതാണ്.പി-നൈട്രോഫെനൈൽ-ആൽഫ, ഡി-മനോസൈഡ് എന്നിവയുടെ ബൈൻഡിംഗിനെക്കുറിച്ചുള്ള ഒരു വിശകലനം, സെഫാറോസ് 4B-യിൽ ഇമ്മോബിലൈസേഷനുശേഷം ConA-യുടെ ബൈൻഡിംഗ് ഗുണങ്ങൾ മാറുന്നില്ലെന്ന് കാണിക്കുന്നു.വിശകലനത്തിനായി റിഡക്റ്റീവ് മെഥിലേഷൻ രീതി ഉപയോഗിച്ച് ഓരോ ഓവൽബുമിൻ ഗ്ലൈക്കോസ്പരാഗൈനുകളും ട്രിറ്റിയം ഉപയോഗിച്ച് ലേബൽ ചെയ്തിട്ടുണ്ട്.ലഭിച്ച Kd മൂല്യങ്ങളുടെ താരതമ്യം, ഗ്ലൈക്കോസൈൽ ശൃംഖലയുടെ വളരെ ചെറിയ ഘടനാപരമായ വ്യത്യാസങ്ങൾക്കൊപ്പം ConA യുടെ ബൈൻഡിംഗ് ഗണ്യമായി വ്യത്യാസപ്പെടുന്നുവെന്ന് കാണിച്ചു.മാൻ ആൽഫ 1-6(മാൻ ആൽഫ 1-3)മാൻ എന്ന ഒരു പ്രത്യേക ഗ്ലൈക്കോസിൽ ചെയിൻ ഘടനയെ ConA തിരിച്ചറിയുന്നുവെന്ന് ഫലങ്ങൾ സൂചിപ്പിക്കുന്നു, അതിൽ C-6-ലിങ്ക്ഡ് മാനോസിന്റെ C-3 സ്ഥാനത്തുള്ള ഒരു ഹൈഡ്രോക്‌സിൽ ഗ്രൂപ്പെങ്കിലും സ്വതന്ത്രമായിരിക്കണം.